viernes, 16 de octubre de 2009

Análisis del genoma del virus influenza AH1N1 pandémico encontrado en Pavo



Se concluye del siguiente análisis genético que el virus influenza A(H1N1)obtenido de pavo, corresponde a la misma variante viral del virus A(H1N1)2009 que ha circulado este invierno en nuestro país.

Análisis:
1.- Se analizaron 8 segmentos de ARN (HA, NA, PA, PB, PB2, NP, NS y M) para nucleótidos, correspondiente al genoma completo del virus.
2.- En el gen que codifica para la Hemaglutinina (HA), se obtuvo un 99.5% y 100% de similaridad con respecto a la cepa A/California/4/2009 y los virus influenza H1N1 estudiados en Chile, respectivamente.
3.- En el gen que codifica para la Neuraminidasa /NA), se obtuvo un 99.5% y 99.7% de similaridad con respecto a la cepa A/California/4/2009 y los virus influenza H1N1 estudiados en Chile, respectivamente.
4.- En el gen que codifica para una Subunidad de la polimerasa (PB1), se obtuvo un 99.8% y 99.9% de similaridad con respecto a la cepa
A/California/4/2009 y los virus influenza H1N1 estudiados en Chile, respectivamente
5.- En el gen que codifica para una Subunidad de la polimerasa (PB2), se obtuvo un 99.8% y 99.8% de similaridad con respecto a la cepa A/California/4/2009 y los virus influenza H1N1 estudiados en Chile, respectivamente
6.- En el gen que codifica para una Subunidad de la polimerasa (PA), se obtuvo un 99.7% y 99.9% de similaridad con respecto a la cepa A/California/4/2009 y los virus influenza H1N1 estudiados en Chile, respectivamente
7.- En el gen que codifica para la nucleoproteína (NP), se obtuvo un 99.5 % y 99.7% de similaridad con respecto a la cepa A/California/4/2009 y los virus influenza H1N1 estudiados en Chile, respectivamente
8.- En el gen que codifica para las proteínas no-estructurales (NS), se obtuvo un 99.8 % y 99.8% de similaridad con respecto a la cepa A/California/4/2009 y los virus influenza H1N1 estudiados en Chile, respectivamente
9.- En el gen que codifica para las proteínas de la matriz (M), se obtuvo un 99.8% y 99.7% de similaridad con respecto a la cepa A/California/4/2009 y los virus influenza H1N1 estudiados en Chile, respectivamente.

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